邓琬字元琬，豫章郡南昌县人。他的高祖邓混，曾祖邓玄，都当过晋朝尚书吏部郎。他的祖父邓潜之，官至镇南将军长史。父胤之，世祖征虏长史、吏部郎、彭城王刘义康大将军长史、豫章太守、光禄勋。
邓琬最开始当本州西曹主簿、南谯王义宣征北行参军，再转本府主簿、江州治中从事史。当世祖起义时，任命邓琬当辅国将军、南海太守。他又率领部队至广州讨伐萧简，攻打了一年多才攻克。又因为臧质造反、被广州刺史宗..逮捕，遇到大赦又被释放。邓琬的弟弟邓璩和臧质一同造反，臧质失败后因随从他而被杀，另一个弟弟邓环也因为这被杀。邓琬因为远离他们，又加上有功劳，被免除死刑而流放远方，仍然是停在广州。好长时间了才得以回到内地，被任命为给事中、尚书库部郎、都水使者、丹陽郡丞、本州大中正。大明七年(463)，皇上巡视历陽、追念做藩王时的故旧功臣，下诏书说：“前光禄勋，前征虏长史邓胤之器局深沉，长期任职，成绩卓著。我当年作藩镇长官时，他最先辅佐我，心一性一忠诚，竭力效诚，我一直不能忘记，往年他的儿子邓璩凶狂，自取灭亡。但邓胤之的功勋应该让他的儿子邓琬继承，现在特别免除邓琬的死罪。可以升为给事黄门侍郎，以表彰邓胤之的忠诚。”
明年(464)，邓琬出外当晋安王刘子勋镇军长史、寻陽内史、代管江州事务。前废帝疯狂没人一性一，他认为太祖文帝、世祖孝武帝都是因为在兄弟辈中排行第三而当上皇帝，子勋在兄弟中也是排行第三，便深深怀疑他而把他当成有威胁的人，用何迈的计策，于是派人带毒一药赐刘子勋自一杀。使者到了以后，刘子勋的典签谢道遇、斋帅潘欣之、侍书褚灵嗣等用驿马使者告诉邓琬这个消息，并哭着请他想法子。邓琬说：“我本来是南方寒族，承蒙先帝的特别厚恩，把他的一爱一子托附给我，我怎能顾惜家门一百多人的一性一命？应该用死来报答先帝的厚恩。幼主昏庸残暴，国家危险万分，他名义上为天子，实际上独夫一个。我们现在应该指挥文武将吏，直接进到京城、和众公卿大臣，一同除去昏君，拥立明君。”景和元年(465)十一月十九日，他宣布子勋的命令。当天便戒严。刘子勋穿着军装出外倾听意见、招集部众，叫潘欣之以口头宣布命令说：“少主昏乱暴虐、都是先生们亲眼得见的，被先帝顾托的大臣都被他杀死。他驱逐一逼一迫伯侯公卿，幽闭侮辱太后，和一些残酷的人，共同制造这些罪恶，呆在京城中的亲王们，都被关起来，等于落入虎口，想方设法但无法逃脱。我本人一则是皇室亲戚，再则是先皇的儿子，怎么能坐观祸乱的发生！现在便想集中九州的人马，写文告给远近各州，一同为国家出力，诸位先生认为应怎么样？”面前的人还未回答，录事参军陶亮说：“少主昏乱发疯，罪恶滔天，伊尹、霍光在古代曾经废除过这种昏君，殿下今天也应该这样做，本州的士大夫，世世代代力行忠诚道义，况且正遇目前这千载难适的机会，我们请求为殿下效劳，作先锋前行。”其余官员都愿听从。文武官员都被晋爵加级。刘子勋转陶亮为谘议参军事、并任中军参军，加号宁朔将军，总管军务。功曹张沈当谘议参军，统管水军，参军事顾昭之、沈伯玉、荀道林等参管书记。南陽太守沈怀宝、岷山太守薛常宝赴郡上任，刚到寻陽，便与新蔡太守韦希直同时被任命为谘议参军，兼任中军参军，彭泽县令陈绍宗等人当将领。
当初，废帝叫荆州逮捕绑送前军长史，荆州行一事张悦东行到盆口城时，邓琬用刘子勋的命令，打开他的枷锁，用自己坐的车欢迎他，让他当司马，加官征虏将军，加官邓琬冠军将军，他们二人共同掌管内外所有的事务。他们派将军俞伯奇率领五百人出外截断大雷、不许商人旅客过往和公家民间的书信事务的进行。又派人统计属下各郡的人民户口，收集武器，十天之内，便得到全副武装的士兵五千人，前进驻扎大雷，在附近两岸建筑堡垒，巴东建平二郡太守孙冲之到郡上任，刚到独石，邓琬让孙冲之当刘子勋的谘议参军，兼中军参军，加号辅国将军，和陶亮共同统率前锋军队。叫记室参军苟道林写出檄文，迅速告知远近各州。
恰遇太宗平定乱子，增加刘子勋位号为车骑将军，开府仪同三司。朝廷的任命刚到，江州将吏都很高兴，他们对邓琬说：“暴乱既然被消除，殿下又可以设立黄阁当宰相，确实是公家私家的大喜事。”邓琬认为刘子勋在兄弟中排行老三，在寻陽的起义活动，和世祖登上皇位情况相同，理所当然一定要成功的。于是把朝廷来的信甩在地上说：“殿下应当建立政权，设置黄阁机构那是我们这些助手的事。”众人听了无不震惊。邓琬和陶亮等修理整顿武器，向其他各州征兵。郢州刺史安陆王子绥、荆州刺史临海王子顼、会稽太守临海王刘子房、雍州刺史沈文秀、冀州刺史崔道固、湘州行一事何慧文、吴郡太守顾琛、吴兴太守王昙生、晋陵太守袁标、义兴太守刘延熙等人同时叛乱。
此前，废帝用邵陵王刘子元当冠军将军、湘州刺史中军参军沈仲玉当道路行一事，走到鹊头，听说寻陽正举行大事，便停在那里，启告太宗该怎么办。太宗认为子勋他们起兵目的是为了消灭废帝，虽然猜疑他们没有放下武器，但并不想首先表示和他们立场不同，叫沈仲玉继续前进上路，太宗的书信还未到达，邓琬听说刘子元停在鹊头没有前进，便派几百人截住他并把他接到寻陽，于是在象尾建立军府，下了一道给朝廷的檄文，文章说：
群龙无首，天下大乱，风起云涌，太祖武皇帝拨乱反正，建立宋王朝，但在位时间不长。太祖文帝继承武帝的大业，四海安定，人民幸福，政治清明，礼法齐备，不幸中年遇祸。刘邵刘诞两个凶贼犯下了滔天大罪，杀君自立，丧尽天良，亲王们被迫屈从，没听说有立志复仇的，只是投降一奸一贼而得富贵，孝武皇帝不顾自己的安危，坚决复仇，率义兵进入京城讨伐叛贼，亲自一杀掉了两个凶贼，九州重新安定，秩序重行恢复。但老天爷连续降祸，孝武帝不幸逝世，皇室的命运又一次改换，新君继位，但荒一婬一残暴。我没有很高的才能，但身负藩王的重任，深深地担心国家的安危，可能会在一个暴君的统治下时刻被灭亡。所以在荆楚招聚英雄豪杰，传檄文告给京城，坚决遵循古人的明确教训，废去昏君拥立明主，为的是使我们皇室七代祖庙重新安定，朝廷有贤明的继承人，怎么会想到本朝的运道还要继续乱下去？杀皇帝的大乱接连出现，以至假借号令，残害贤臣，湘东王自立为皇帝，反而比先前的暴君更加凶恶，蔑视我们皇室的规矩，打乱我们皇室的继承秩序，杀我们的亲王兄弟，显出豺狼般的举动，做出赵王司马伦、河间王司马颖的叛逆举动。强夺我们的皇位，诬害上天和人民。不管怎么说，我的亲王兄弟们，还有十三个存在，老天有什么理，怎么让我们家不能祭祀先人？
当年强大的周朝政治开始削弱时，晋国郑国诸侯得以效忠；兴旺的汉朝中间曾受破坏，刘氏兄弟努力抗争，这些皇帝的枝叶远宗能够忘记自身的灾乱，况我是皇帝的儿子，少帝的兄弟，以情以义都该勤王，因此在本州号召众人为国家复仇，所以泣血发誓，一定要恢复朝廷和先人的祭祀。现在派辅国将军谘议参军兼中直兵孙冲之、龙骧将军陈绍宗，率领老虎般的猛士，聚合二万兵士，沿江迅速出发，直抵白下城。龙骧将军兼领中直兵薛常宝、建威将军中直兵沈怀宝，率领手持方天画戟的兵士、轻骑千人，直接从南州出兵，直抵朱雀桥。宁朔将军谘议兼领中直兵陶亮、龙骧将军焦度，率步兵三万，沿长江江岸迅速攻打石头城，建威将军张冽、龙骧将军何休明，率勇士越过金陵；向东指向苏州。龙骧将军张系伯、龙骧将军陈庆，率先锋五千，弓箭手一万，从班渎出发，在西明会合，冠军将军、寻陽内史邓琬，率湘州、雍州勇士四万人总统各路会集京师。征虏将军兼领本府司马张悦，统率战舰一千艘，水军五万，在后面接应前面的部队，冠军将军豫章内史刘衍，宁朔将军武昌太守刘弼、宁朔将军西陽太守谢稚，建威将军兼中直兵晋熙太守阎湛之，都聚集本郡，为本府效劳。后将军、郢州刺史安陆王子绥对我推戴备至，士兵早已训练齐整。冠军将军、湘州刺史邵陵王刘子元沿江而下，率领部队迅速到来。前将军、荆州刺史临海王刘子顼在陕西整练一精一兵，愿意出动数万增援我们，辅国将军、冠军长史，长沙内史何慧文，受先帝提拔，忠诚效力。冠军将军、雍州刺史袁靑，不谋而合从汉南出发。建威将军、顺陽太守刘道宪，心怀忠义，出兵三千支援。梁州、益州、青州、徐州、豫州、吴郡、会稽郡，都派使者报信，愿意效忠，发誓一起行动，内外相应。我亲率十万大军沿途东进。我军的队伍充满山川，我军的武器照亮了原野，军鼓震撼了大地，吼声惊动了苍天。所有各个将领，都忠诚守分，智谋百出，果断英勇，谋略变化无方。我军水陆并进，数路长驱，兵舰越过险阻，士兵日夜争先。用这个队伍进攻，谁能抵挡？用这个队伍起事，苍海可填。
朝中诸位先生或者在先朝蒙受先帝提拔，感激先帝厚恩；或者世代忠良，看见国家的危险便踊跃奋争。但是现在被人胁迫，无路效忠。我军四面密布，形势喜人，先生们因势而起，不需要观望了。应该转祸为福，相机而动，当年周公召公和三叛在同时代，金日石单与霍光和上官桀共同侍候一个皇帝，邪人正人混在一起，哪一代没有！但是做了正义的事业便名播四海，恶人当道则正义被压。你们应当学习纪季进入齐国、陈平投身汉朝的榜样，那样便能安全获得保障，名誉得以保护。你们明智地选择好的榜样，不要学坏例子。如果心想投机，或左右两投，那么将会五族诛灭，格杀不论。我军的赏罚明如日月。巫山已燃一烧，荆棘和艾草同时被毁。我希望你们选择光明的道路，不要走上毁灭的歧途。檄文传到你那里，各人迅速的明白这些意识。
刘子勋同时下令：能杀太宗的人封万户侯，布绢二万匹，金银五百斤，其余各个等级都有赏赐。
太宗派荆州典签邵宰通过驿站回到江陵，经过襄陽时，袁靑派他给邓琬带信，劝说邓琬不要解除武装，且上表劝刘子勋做皇帝。郢州接受寻陽开始的檄文，后又听说太宗即位，便解除武装，放下武器。再又听说寻陽继续戒严，因而袁靑又响应。郢州州府行一事录事参军荀卞之非常害怕，担心被邓琬所指责，马上派谘议兼领中兵参军郑景玄带领军队迅速东下，同时也运送军粮。邓琬于是称说吉祥瑞气，赶造皇帝坐的车子和穿的衣服，说什么松滋县豹子自动归来，柴桑县送的竹子有“来奉天子”的字，又说青龙出现在东淮河中，百鹿被发现在西岗。又叫顾昭之写成《瑞命记》。建立宋庙，设立坛场，假传崇宪太后玉玺的命令，叫各个郎将吏士上表劝子勋做皇帝。泰始二年正月七日，在寻陽城即位，改景和二年为义嘉九年。让安陆王刘子绥当司徒、骠骑将军、扬州刺史、寻陽王子房当车骑将军，临海王刘子顼为卫将军，他们同时都是开府仪同三司。以邵陵王刘子元当抚军将军。当日乌云满天，细雨氵蒙氵蒙，行登位礼时忘掉了称呼万岁。又改造刘子勋以前坐的车子，把其中的车轮去掉，变成新的辇车(皇帝坐的车子)，辇车被放在刘子勋新起的宫殿西边，当天傍晚，有些鸠鸟在里面栖息，在车帘上栖息的是号鸟鸟，此外还有一些秃鹰歇在城墙上面(这些都是不祥之兆)。刘子绥拜官司徒的那一天，乌云蔽日，雷电交加，霹雷把他住的黄阁柱子也震动了，黄阁的房顶掉在地上。另外有鸱鸟栖息在他帐子上(也是不吉之兆)。刘子勋以邓琬当左将军、尚书右仆射，张悦为领军将军、吏部尚书，征虏将军的官职还是照旧。升袁靑官职为安北将军，另加尚书左仆射。临川内史张淹当侍中。江州府的主簿顾昭之，武昌郡太守刘弼同时当黄门侍郎。鄱陽内史丘景先、庐陵内史殷损、西陽太守谢稚、后军府记室参军孙诜、长沙内史孔灵产、参军事沈伯玉、荀道林都当中书侍郎、荀卞之当尚书右丞、府中主簿江义当尚书右丞、本府主簿萧宝欣当通直郎。邓琬大儿邓粹、张悦的儿子张洵都当员外郎。邓粹还兼任卫尉。张洵的弟弟张冽当司徒府主簿，建武将军，领军主、晋熙太守阎湛之加官宁朔将军。庐陵内史王僧胤当秘书丞。桂陽太守刘卷当尚书殿中郎。褚灵嗣、潘欣之、沈光祖当中书通事舍人。其余各个州郡官吏，都加官晋爵。
邓琬本一性一庸俗愚蠢，贪得无厌，对于金钱财物喝酒吃饭，都亲自管理。到此时，他的父子兄弟都竞相卖官鬻爵，叫奴仆们到集市上贩卖财物。另外他们又唱歌跳舞赌一博下棋，日夜相继。另外他又妄自尊大，以为自己了不得，有来访问他的手下客人，有等上七天不能见到他的，大小事务他全部委托给褚灵嗣他们三个人，这些小人们横行霸道，作威作福。普通士人和百姓无不气愤，这样从内到外已呈现分裂的态势。
太宗派散骑常侍、领军将军王玄谟带领水军南向讨伐，吴兴太守张永在后面增援，又派宁朔将军寻陽内史沈欣之，宁朔将军江方兴，龙骧将军刘灵遗带兵驻守在虎槛，当时，东方叛军势头正猛，张永江方兴只得回过头来到东方讨伐，尚书部下了一道诏书说：
治乱循环，善恶交替，大宋王朝的基业，将永远长存。先帝们留下的事业，再次发扬光大。但是昏乱的废帝曾继承皇位，国家的纲常混乱了。他给人民带来了巨大的祸害，犯下了滔天的罪恶。士大夫官员有的被屠一杀，老百姓身陷于水深火热之中，人和神同时愤怒，朝廷和民间同时哭泣。当今皇上英明贤圣，应天顺人，心怀国家，日夜忧虑，担心朝廷被毁灭，人伦被破坏，汉族被压迫。突发神威，把一切灾难消除，在谯门杀掉夏桀般的暴君而不需要鸣条那样的战争，消灭商纣那样的恶人而不需孟津那样的出动大军。中华民族得以安宁，日月重现光明，嘹亮的歌声重新在管弦乐器中发出，龙凤雕饰再次在帽子上呈现，普天同庆，万国归诚，刘子勋在乱世起兵，是一种罪恶行动。在太平时代穷兵黩武，则是不识好歹，窥一探皇室宝座，一逼一迫两江人民，欺骗皇上，压迫士人，远近已经看得清清楚楚了。皇上赫然愤怒，准备讨伐叛逆，叫将帅们整训军队讨伐反贼。
现在派宁朔将军，寻陽内史沈攸之，带领七千一精一兵首先乘船前进。龙骧将军刘灵遗带领勇一猛的羽林禁军，迅速前进，假节、统率南伐的前锋诸军事、冠军将军、兖州刺史殷孝祖，率领中原劲兵，迅猛前行。使持节、车骑将军、江州刺史曲江县开国侯王玄谟率军五万，作前面各军统帅。使持节、侍中、司徒、扬州刺史建安王刘休仁，统率朝廷各路大军作为讨伐元帅。龙骧将军刘面力，宁朔将军刘怀珍，带步兵和骑兵五千，直接攻向敌人一大雷戍城。宁朔将军柳伦、司州刺史庞孟纠率领淮河颍河流域一带的快速骑兵，从侧翼迂回攻击西陽，使持节、骠骑大将军、豫州刺史山陽王休..统率步兵百万，坐着河上的大船，以及骠悍的代州骏马在江边巡逻，手持锐利的武器在京城一带守卫。真是军鼓撼动天地，金戈响达云霄。我军相互配合，水陆并进。冠军将军武念，则带领雍州司州的一精一兵先期占据樊汉地区。徐州刺史申令孙，带着彭城宋国一带勇士也准备上路。皇上一定会亲自驾临六军，在江上指挥，我军旌旗蔽日，船舰填满苍海，必将百战百胜。
当年西汉时，吴楚连横造反。燕王淮南王的劲兵騷扰朝廷时，真可谓声震关中，但结果却如同大雾见日即散，尘土见风自消自灭，这难道不是最好的例子吗？而今天你们竟然守着一个小小的寻陽城，等待朝廷的讨伐，驱逐一些乌合之众抗衡全国的军队。一旦我军包围你们，向你们发动进攻，好比是疾风吹蓑草，烈火烧草原，你们将被彻底消灭，这是显而易见的。皇上同情各位将吏，哀痛我们的人民，有什么罪过，却被凶一党一贻误。所以宣示远近，叫你们重开改过自新的道路。如果执迷不悟，抗拒朝廷权威，必然招致玉石俱焚的不幸结局，那时便悔之已晚。诏书说四个造反的亲王年龄尚小，不幸陷入灾祸中，两军交战的时候不准乱加伤害，他们如果有半点损伤，必然要严惩不贷。对方起事的一些主帅们，你们应该好好地保护亲王们，你们过去的失误都不再追究，如果你们迷途知返的话。
邓琬派孙冲之率领陈绍宗胡天秀薛常宝张继伯焦度等先锋兵一万，占据赭圻。孙冲之在路上给刘子勋写信说：“舟船已办好了，武器也准备好了，三军踊跃振奋，人人竞相效命，我们准备沿江东进，直捣白下戍城，希望早点派陶亮等参军迅速接应我们，分别占据新亭、南州，则能平定局势。”于是刘子勋给孙冲之加官卫将军，陶亮等右卫将军率领军队同时东下。郢州司马郑景玄、荆州司马刘亮、湘州司马何昌、梁州司马柳登、雍州司马宗庶等集合二万人也一同东下。陶亮本来没什么本事，听说建安王休仁等亲自前来，殷孝祖又准备到来，不敢前进，只好驻军鹊洲。
当时邓琬派阎湛之前来侵犯庐江，台城将领龙骧将军殷佛荣接受命令讨伐阎湛之，另外又派殷佛荣率领铁骑一千，回过来向南讨伐。三月三日，在水路旱路同时进攻赭圻，陶亮等人率领各军前来援救，战斗中殷孝祖被流矢射中而死，将军朱辅之、申谦之、张灵符都失败了。朱辅之的副将正员将军皇甫仲远、申谦之副将虎贲中郎将徐稚宾都战死了，殷孝祖的支军将领范潜带领手下五百人向陶亮投降。当时讨伐东方叛军的朝廷军队已获得了胜利，江方兴重新回到虎槛，建安王刘休仁派江方兴、刘灵遗各带三千人帮助守卫赫圻，叫江方兴统领殷孝祖的军队。沈攸之代替殷孝祖作前锋都督，孙冲之对陶亮说：“殷孝祖是一员骁将，刚一交战便被我们打死。天下大事已经定了一大半，不必再打，只需直取新城。”陶亮不同意孙的意见。太宗此时派员外散骑侍郎王道隆到赭圻督战。孝祖死的第二天，建安王刘休仁派将军郭秀之率骑兵三千接受沈攸之指挥。沈攸之于是带郭秀之和辅国将军步兵校尉杜幼文、宁朔将军屯骑校尉垣恭祖、龙骧将军朱辅之、元外散骑侍郎高遵世、马军队长龙骧将军顿生和殷佛荣等三万人，在凌晨前攻击敌军，朝廷军队猛烈攻击，大败西军，杀掉几千西方士兵，一直追到姥山才退回，孙冲之等人在湖、白口筑的两个小城，也被将军张兴世攻下。陶亮听说湖、白二城陷落，非常害怕，连忙呼叫，孙冲之回到鹊尾，留下薛常宝，代替孙冲之守赭圻。西军首先在姥山和各山岗分立的营寨也各自败回，共同占据浓湖，浓湖城正是建在鹊尾这地方。
此时战争正剧烈进行，朝廷货用不足，劝老百姓每家上交二百斛米、五万钱、杂谷五百斛，同时赏赐荒远县令官；上等白米三百斛，八万钱杂谷一千斛的，同时赏赐五品的正令史官员，如果达到上述要求，想留在家里享受一个四品官的待遇也可以；上交四百斛米、十万钱、杂谷一千三百斛的赏赐四品令史官职，满了，可以在家享受三品官的待遇；上交大米五百斛、十五万钱、杂谷一千五百斛，赏赐三品令史官职，如果满数了，在家里享受监守待遇也可以；上交七百斛米、二十万钱、杂谷二千斛赏赐荒郡太守官职，如果想在家里享受亲王尚书令官待遇也可以。
邓琬又派辅国将军豫州刺史刘胡率领二万人马，一精一锐骑兵二千，前来驻扎鹊尾，刘胡是一位老将，多次立战功，一贯一奸一猾有些计谋，被众人推戴，沈攸之等人有些怕他，当时刘胡的老同乡蔡那，佼长生，张敬儿，都带兵隶属沈攸之，正在赭圻。刘胡写信招降他们，蔡那等人都拒绝了，刘胡又请蔡那等人对话，说过去的旧事。蔡那等人质问他，叫刘胡归顺朝廷。刘胡便回军进驻鹊尾，也没有献出什么谋略。辅国将军吴喜平定三吴后，率领他手下五千人，同时运物资，抵达赭圻，在战乌山建堡垒，又分派一千人，乘小船两百，和佼长生在一起作为游击部队。
薛常宝粮食吃完了，请求刘胡增援。三月二十九日，刘胡率领步兵一万，半夜凿山开路用布袋运米，前来增援赭圻的薛军。早晨到赭圻城下，还隔着小城濠，不能运进去。沈攸之这时连忙带领各路军队进攻敌军，队长郭宗之、荀僧韶、队长韩欣委等人率兵三千，作为沈攸之的援兵。刘胡打开通城吊桥，荀僧韶等手持盾牌上前猛击，使吊桥重新断毁。军帅刘沙弥率轻军深入敌阵，进到刘胡面前，被刘胡部下杀了。沈攸之驱马攻入敌阵，回来时，被敌人追击骑兵刺中骑兵军帅殷佛荣，武保救助他回来。朝廷军仍继续猛烈进攻。杀伤敌人很多。刘胡的人马大败，于是丢下粮食和甲兵，沿山逃跑，沈攸之等乘胜追击，又杀了很多敌人，刘胡也受了伤。勉强回到军营。薛常宝恐惧得手足无措，又派人告诉刘胡，想突围逃回去。四月四日，刘胡又亲自率几千人迎接薛常宝，薛常宝等人开城突围逃跑。沈攸之率辅国将军沈怀明、队长周普孙、江方兴、申谦之等又合力进攻刘胡等，吴喜也接着率兵支援。吴喜被刘胡军包围非常着急，有人前来牵捉吴喜的坐骑，他的手下蔡保用刀砍那人，断了那人的手，然后才逃出，正员将军队长卜伯宗，江夏国侍郎队长张涣，奋战殉国，卜伯宗即益州刺史卜天与的儿子。沈攸之、吴喜等人一大战一整天。薛常宝、张继伯、胡灵秀、焦度等都受了重伤，逃回大营，赭圻陷落。伪宁朔将军南陽太守沈怀宝，伪奉朝请兼中书舍人督战谢道遇被斩首，另外俘虏敌军几千人。陈绍生坐一小船逃到西岸，他的部众都逃到鹊尾。建安王刘休仁从虎槛前往进驻赭圻。刘胡派陈绍宗、陈庆率领轻舰小船二百，大船五十艘，到鹊尾州之外挑战，吴喜、张兴世、佼长生等人进攻刘胡。吴喜部下军帅吴献之飞舰冲击，所向披一靡一，无数敌人被斩首擒获，另外有些投水而死，一直追击到鹊尾州上才回来。太宗担心刘胡等人也许会从陆路迂回京师，派宁朔将军、广德令王蕴带一千人防守鲁头。
当时刘胡兵众强盛，朝廷内外非常担心，太宗想安定人心，派吏部尚书褚渊到虎槛选用将帅以下人物作朝廷官吏。申谦之、杜幼文用这机会请求做黄门郎，沈怀明，刘亮请求做中书郎，建安王刘休仁叫褚渊接受将帅的要求，太宗不允许。他说：“忠臣为国而死，不要求报答，在困难中要挟朝廷，难道是做臣子的道德吗？”
始安内史王职之，建安内史赵道生，安成太守刘袭都在本郡宣布归顺朝廷，邓琬于是派龙骧将军廖琰率领几千人，同时征集庐陵百姓进攻刘袭。刘袭和郡丞檀玢进行抵抗，但彻底失败。檀玢在战斗中被杀，刘袭丢下郡务逃跑，只好占据险要防守而已。廖琰抢掠一番便回来了，刘袭再次出来，占据本郡。
当时齐王萧道成正率军在北方讨伐敌人。齐王世子萧赜正当南康郡赣县县令，邓琬派人逮捕萧赜，萧赜的心腹萧欣祖、桓康等数十人，带萧赜的长子逃窜在山林中，招募得一百多人，攻打郡城救出萧赜，萧赜自称宁朔将军。南康相沈肃之、前南海太守何昙直、晋康太守刘绍祖、北地人傅浩、东莞人童禽等人，在本郡宣布起义，邓琬征调始兴相殷孚当御史中丞，同时叫他带领本郡人前来赴援，殷孚人马很多，萧赜在揭陽山避开殷孚。邓琬派武昌人戴凯之当南康相，萧赜率兵进攻他，戴觊之战败逃跑。萧赜派队长檀文起带一千人到西边防守西昌、和刘袭相互响应，邓琬又派廖琰和他的中兵参军胡昭等人在西昌建立堡垒，守在堡中伺机攻击。邓琬又调豫章太守刘衍当右将军、中护军，殷孚代他当豫章太守，统率上游五郡军事，以防卫刘袭等人。
衡陽内史王应之率领郡中文武官兵五百人起义袭击在长沙的何慧文，直抵城下。何慧文率领左右出城抵抗，王应之奋勇拼杀，杀死好几千人，于是和何慧文对面接战，他砍了何慧文八道伤口，何慧文把他的双脚砍断，于是杀了他。当时湘东国的侍郎虞洽为太宗收租税，在湘东劝太守颜跃起兵响应朝廷，颜跃不同意，虞洽于是投奔桂陽招募好几百人。回来攻打颜跃，颜跃害怕，只好求和，虞洽同意了他，于是虞洽有二千部众。当时邓琬调何慧文带兵东进寻陽。从长沙出发，已走了几百里，听说虞洽起兵，于是回师攻打虞洽，虞洽等不久便战败逃跑。
殷孚离开始兴后，让郡中五官椽谭伯初留下来管理郡中事务。当地人刘嗣祖等人杀掉谭伯初占据此郡宣布起义。邓琬派始兴太守韦希真、鹰扬将军杨弘之率兵一千讨伐刘嗣祖，刘嗣祖另派部分兵力出行南康和萧赜汇合。韦希真等人认为起义人马很多，驻在庐陵不敢前进。广州刺史袁昙远听说始兴起义，派手下将领李万周陈伯绍率兵进攻刘嗣祖，刘嗣祖派兵戍守..陽，李万周也立堡垒互相对峙。刘嗣祖派人骗李万周说：“寻陽已被平定，朝廷派刘面力当广州刺史，将要到了。”李万周信以为真，于是回过头来袭击番禺城，半夜时用长梯进城，袁昙远胆怯无防卫，听说李万周反了自己，于是当日出逃，李万周在城中追上他并将他杀掉，交州刺史檀翼被人代替回到广州，家财仍以巨万计。李万周诬陷他造反，袭杀了他。于是他抢掠公家私人很多金钱布帛，缴获袁檀的珍宝，都收入自己腰包。
袁靑调集雍州所有的兵士，东下赶赴寻陽城，当时孔道存当卫军长史，代管荆州事务，邓琬以黄门侍郎刘道宪代替他，让孔道存当侍中，代管雍州事务。当初柳元景被杀时，柳元景弟弟的儿子柳世隆当上庸太守，百姓和官员们共同把柳世隆藏起来。袁靑起兵，召见柳世隆，柳世隆没有应命。袁靑既然东下，柳世隆于是纠集当地守人二千多在上庸起义，前来袭击襄陽，孔道存派将王式民、康元隆等人在万山追击，柳世隆大败，回到本郡继续防守。
沈攸之等人和刘胡长时间相互对峙，但还是没有决出胜负。太宗又派强一弩一将军任农夫、振武将军武会仓、冗从仆射全景文、军帅刘伯符等带兵来援。沈攸之修造船舰，材料不足，想不出办法。恰遇邓琬送五千片大木头供一应刘胡。不料大风突起，江潮奔涌，大木头突破栅栏流一出江外，刘胡等看着没有办法。木头把刘胡的那些船撞坏了很多，撞死十人。这些木头沿流而下，正好停在沈攸之等人的营地附近，于是材料充足。
邓琬任袁岂页为都督征讨诸军事，并赏给袁靑鼓吹一套，六月十八日，袁岂页率领楼船一千艘，前来驻进鹊尾，张兴世建议越过鹊尾上据钱溪断绝敌人粮道。刘胡屡次进攻钱溪，都不能攻克，这事请看《张兴世传》，刘亮率他的部队到刘胡营下面，刘胡派他的副将孙犀和张灵、焦度带铁骑五十匹，越过涧中捉拿刘亮，没有成功，孙犀只好打马回去，刘亮叫左右会射箭的人夹一着射击他们，孙犀掉下马来，朝廷兵士砍下孙犀的脑袋，张继伯副将率领部队前来投降。刘亮的营寨，深入敌人腹部中间。袁岂页非常害怕，说：“敌人进入我们的肝脏中，怎么能活下去？”刘胡率领轻快小舰四百艘，由鹊头内路，准备攻打钱溪，不久对他的长史王念叔说：“我自小一便熟习步兵作战，不会水上打斗，如果是步战的话，常常轻易组织以几万人协同作战，水战则在一船之上，舰船各行其道，不再相互联系，最多三十人一同作战，这不是万全计策，我不干。”于是托名得了虐疾，住在鹊头不出击，只派龙骧将军陈庆率领三百艘船向钱溪行进，告诫陈庆不用进攻，张兴世、武会仓我很熟悉，自然是会逃跑的。陈庆到钱溪，不敢进攻，只好越过钱溪，在梅根建立营寨，刘胡另派王起带百艘小船攻打张兴世，张兴世反击并大败他，刘胡率领剩余船舰回来，对袁靑说：“张兴世营寨已稳固了，不能一下攻克，昨天的战斗，谈不上损失，陈庆已和南陵、大雷各路军队共同截断他的上游，我们大军在此地，鹊头各将又截断他的下流，张兴世已落入我们的包围之中，不需再担心。”袁岂页恨刘胡不进攻，对刘胡说：“粮道阻塞，那怎么办？”刘胡说：“他们能逆流越过我们在上游扎营，我们为什么不能沿流而下在他们下面扎营呢？”袁岂页又派刘胡率领步兵二万，铁骑一千，前往进攻张兴世，刘休仁于是命令沈攸之、吴喜、佼长生、刘灵遣、刘伯符等人进攻浓湖，造皮舰十艘，毁掉敌人栅栏，苦战一天，大败袁岂页军队，袁岂页被攻得紧急，派人请刘胡回来。
张兴世既然占据钱溪，江路断绝，刘胡的部下开始没有饭吃，邓琬大量地运送军粮，但害怕张兴世而不敢东下，刘胡派他的将领迎接，又被钱溪的张军打败，军粮覆没干净，三十万斛大米被烧，刘胡的部众非常惶恐，刘胡副将张喜前来投降，说刘胡想叛变。八月二十四日，刘胡骗袁岂页说：“我再率二万步骑兵，沿江而上进攻张兴世，同时运下大雷的余粮。”叫袁岂页把全部的马匹给他，当天夜里便丢下袁岂页逃跑，奔向梅林，先叫薛常宝准备船舰，同时拨出南陵各路军队，烧掉大雷诸城而逃。袁岂页听说刘胡逃走，也丢下部队而逃，到青林时被杀。
刘胡率几百艘军舰二万人逃向寻陽，骗刘子勋说：“袁岂页已投降，军队都逃散了，只有我率部下逃回，应该迅速准备，以备一战，誓死不降。”于是在当夜直接逃向汉口。邓琬听说刘胡逃走，惶恐得无计可施，叫褚灵嗣等前来商讨，都无计可施，这些人只是说再召集兵力，每人加赏五级，也有说只加三级的。张悦这时才办侄儿张治的丧事，又传称叫邓琬商量大事。叫左右的人在布帐后面埋伏，告诉他们：“你们如果听我要酒，便出来。”邓琬到后，张悦说：“你最先主张造反，但现在情况不妙，我们将想想什么办法？”邓琬说：“只有将晋安王斩首，封存府中金银，向皇上谢罪而已。”张悦说：“今天怎么能出卖殿下求生呢？”于是喊要酒，第二次呼叫时，张悦左右的人害怕而不敢响应，他的第二个儿子张洵提刀走出来，其余的人也跟着出来，便杀了邓琬。邓琬死的时候，六十岁，当时中护军刘衍在座上，惊起抱住张悦，张左右的人也想杀掉他，张悦回头说：“不关护军的事。”于是没有杀。
潘欣之听说邓琬死了，带兵来了。张悦叫人告诉他说：“邓琬谋反，已被杀了。”潘欣之于是返回，捉住邓琬的儿子们都杀掉。张悦于是装好邓琬的脑袋驾着一叶小船驰下，到建安王刘休仁那里投降。蔡那的儿子蔡道渊因为自己的父亲为太宗效力，被关在作部，趁乱中打开枷锁进入寻陽，逮住刘子勋关起来。沈攸之等部队到江州，在桑尾屋下将刘子勋斩首，在京师传观他的脑袋。刘衍和其余同时造反的都被杀掉。吴喜张兴世前进到荆州，沈怀明到郢州，刘亮、张敬儿到雍州，孙超之到湘州，任农夫到豫章。他们到后都平定了叛乱。
刘胡逃到汉江流域，等到了石城，只剩下几个骑兵。竟陵郡丞陈怀真是陈宪的儿子，听说刘胡经过，率领几十人截断刘胡逃的去路而追击他，刘胡一路人马已很疲倦，自知活不成，于是随同陈怀真进城，说他很渴，陈给他酒，刘胡喝酒完了，一抽一出佩刀自一杀，没有杀死，被斩首送往东城，张兴世的弟弟张僧产追击刘胡，还未到石城，恰逢送刘胡脑袋的人，他便带回竟陵城，杀了陈怀真，窃据这个功劳。郢州行一事张沈、伪竟陵太守丘景听先说他们失败了，扮成和尚逃走，被追上杀掉。
荆州人听说浓湖平定，商议再派部队和郢州汇合，又想截断东路占据巴陵。几天不能决定下来，于是派将领赵道始在江津修筑堡垒，任演戍守沙桥。各关门津要都有守兵。但叛军的人心已离散，将士纷纷逃跑，他们又商量拥着刘子顼跑到益州，乞求萧惠开门保护，典签道预、邵宰觉得不妥，说：“近来接到诏书的各藩镇如果能改正错误，归顺朝廷的，全部恢复本来爵位，况且任叔儿已截断白帝城，杨僧嗣据有梁州，即使想逃到西方，又怎么到得了。”阮道预、邵宰便和刘道宪解散民丁，派人谢罪，荆州治中宗景、士人姚俭等率兵入城，杀掉刘道宪、阮道预和记室参军鲍照，抢掠府库，没一点剩下的，捉住刘子顼投降。
当初，邓琬向巴东调兵，巴东太守罗宝称推辞说：“本郡和土蛮相邻，兵力不够。”巴东人任叔儿聚众起义，派人要请罗宝称一同起事，宝称犹豫不决，突然得病死了，任叔儿于是自称辅国将军，带兵占据白帝，杀掉罗宝称两个儿子，阻挡东方去路守住三峡，萧惠开派费欣寿等五千人进攻任叔儿，叔儿迎战，大败萧军，杀了费欣寿，刘子顼又派中兵参军何康之兼领宜都太守，讨击任叔儿，何康之的部队刚到峡口，便被少数民族头领向子通打败，只身而逃，任叔儿于是固守白帝。
孔道存得知寻陽已被平定，派人归顺朝廷。不久听说柳世隆刘亮将要到来，他的部下全部逃跑，孔道存和他的三个儿子同时自一杀，何慧文开始打算与寻陽同道，他母亲不允许他这样，于是带他女儿回到江陵，马上便嫁出他的女儿。何慧文文武全才，颇有些手力。虽然杀害了王应之，太宗特别原谅他，吴喜宣告诏书赦免他，何慧文说：“我既然陷入逆一党一亲自一杀害了忠义之士，虽然皇上网开一面，但有何面目重见天下士人。”准备毒一药喝下，他的门生把药倒掉，于是他绝食而死。
颜跃担心虞洽回到本郡，说他开始时也附和反一党一，暗中叫人杀了他。
当初淮南定陵人贾袭宗的本县已被刘胡占据，他带二十人投奔沈攸之，沈攸之告诉建安王刘休仁，刘休仁任他当司徒参军都护，叫他回到乡里，招集人马，不幸被刘胡捉住，刘胡用火烧他，问他朝廷军队的消息，他一个字也不吐，睁着眼睛对刘胡说：“你在国内起兵侮弄人民，岂页觎皇位。没听说有什么奇谋远计，只知造一些炮烙般的刑罚，我本来准备杀身成仁，死有什么了不起！”刘胡于是杀了他，前军典..坚决不响应叛军，被邓琬杀掉，其余归顺朝廷被杀害的同时被皇上所怜悯。太宗下诏书说：“前镇军参军督护范道兴是我的老部下，曾经在北藩中服务，又在南方服役，遭遇不幸，他心怀皇室，因守臣节，被小人杀害，他的忠诚令人感叹，实在值得悲伤和同情，可以追赠员外散骑侍郎。南城令鲍法度、后军典..冯次民、永新令应生新建令库延宝、上饶令黄难等，反对叛乱拥护朝廷，想起他们的可贵的行动，应该得到追认褒奖，可赠给应生奉朝请，法度南台御史，次民、延宝，都为员外将军。”
有关官员上奏：“宁朔将军、督豫州的梁郡诸军事、豫州刺史、兼领南梁郡太守竟陵张兴世统率水军，屡战屡胜，前进截断在钱溪上流的敌人，又在贵口经过苦战，平定凶一党一，现在封为南平郡作唐县开国侯，食邑一千户。宁朔将军、参司徒中直兵军事、广平佼长生，和张兴世同时统率水军，也进行多次战斗，在张兴世占据钱溪时，佼长生独立在关健地方抵抗敌人，比张兴世略逊一等，现在封为武陵郡迁陵县开国侯，食邑八百户，宁朔将军代理西陽太守吴兴全景文、尚书比部朗吴兴孙超之，代理辅国将军、南彭城刘亮等人，都经过晋陵苦战，景文同时又北讨破釜敌军，用水军截断敌人粮运，也经历了葛冢、石宗二处激战打败敌人，刘亮南伐经过激烈战斗，又处在最危险的地方，全景文现在封爵西陽郡孝宁县，孙超之封长沙汨罗县，刘亮封顺陽县，都是开国侯，每人食邑六百户。代理辅国将军骠骑司马刘灵遗、宁朔将军右军蔡那、宁朔将军屯骑校尉殷佛荣等人，负责封锁道路，都经过激烈战斗，灵遗封为新野郡新野县，蔡那封始平郡平陽县，佛荣封湘东郡临蒸县，都是开国伯，每人食邑五百户。代理辅国将军、左军吴兴沈怀明，龙骧将军、积射将军东平周盘龙，司徒参军南彭城，李安民等人，怀明经过晋陵战役打败敌人，又随水军南伐，负责封锁道路，盘龙虽未统管军队，都经历过激烈战斗，先登陷阵。安民又随同张兴世截断钱溪敌人粮道，又统率军队在贵口打败敌人。现在封怀明建安郡吴兴县，盘龙封晋安郡晋安县，安民封建安郡邵武县，都是开国子，食邑每人四百户，代理辅国将军。游击将军彭城杜幼文，龙骧将军羽林监太原王穆之，龙骧将军羽林监沛郡人周普生，员外散骑侍郎宋重恩等五人，幼文经历晋陵战役打败敌人，在军中负责进攻道路。南伐浓湖时，普孙作沈攸之的副官，统率各路军队，穆之、朱重恩都南伐有功，现在杜幼文封邵陵郡郡陽县，穆之封衡陽郡衡山县，生封始平邵武功县，普孙封顺陽郡清水县，重恩封南海郡龙州县，都是开国男，每人食邑三百户。
江方兴因战功当太子左卫帅，敌人还未平定时，便病死了，被追封为武当县侯，食邑五百户。江方兴，济陰人，出身士族。龙骧将军虎贲中郎将董凯之随同张兴世击破湖白二城，先登陷阵，封河隆县子，食邑四百户；队长张灵符，向东南征讨有功，封上饶县男，食邑三百户；前征北长兼行参军杨覆，因贵口之战立功，封为绥城县男，食邑二百户，后来追认虞洽、檀玢给事中，以李万周作步兵校尉，陈怀真因为杀刘胡功劳，追封永丰县男，食邑三百户。